HR系統(tǒng)實施過程是需要企業(yè)員工的積極配合，但是沒有人喜歡改變自身的習(xí)慣，實施HR系統(tǒng)大量的工作容易造成員工的抵觸和不滿，若是在高層政策宣導(dǎo)不夠的情況下，容易讓員工對HR系統(tǒng)產(chǎn)生信心危機(jī)，不進(jìn)行積極配合，從而排擠系統(tǒng)的實施，這樣輕則會導(dǎo)致HR系統(tǒng)實施延遲，嚴(yán)重會直接導(dǎo)線系統(tǒng)項目失敗。

目前很多企業(yè)的HR系統(tǒng)項目都是由HR部門提出的，整個項目基本由HR和IT部門主導(dǎo)，但在需求制定過程往往只考慮自身部門的功能與便利性，并沒有考慮到企業(yè)其他業(yè)務(wù)部門的需求，還有中高層所要的信息整合與公司決策管理需求，這樣造成HR系統(tǒng)無法完全滿足企業(yè)需求，無法推進(jìn)全面的信息化管理。

HR系統(tǒng)涉及較為多專業(yè)的IT方面知識，IT部門的確是要負(fù)擔(dān)較大的技術(shù)責(zé)任，但他們具備的僅僅是專業(yè)IT知識，對企業(yè)人力資源管理情況并不熟悉，其主要是提供IT方面的協(xié)助，從軟件廠商與HR系統(tǒng)產(chǎn)品評估到各部門意見整合，都不應(yīng)該由IT部門主導(dǎo)，真正在實施過程與HR部門以及其他部門之間的配合才是HR系統(tǒng)實施成功的重大因素。

很多企業(yè)HR系統(tǒng)實施失敗是因為派用經(jīng)驗不足的管理層或是IT部門負(fù)責(zé)，這些人員在沒有充分了解的情況下很容易與軟件廠商形成認(rèn)知差異，同時HR系統(tǒng)實施過程跨部門整合改革之間容易產(chǎn)生的沖突，若部門之間的和與軟件廠商的爭議沒有領(lǐng)導(dǎo)層進(jìn)行協(xié)調(diào)，HR系統(tǒng)需求功能細(xì)節(jié)沒有領(lǐng)導(dǎo)層進(jìn)行確認(rèn)，那這樣系的實施會十分難以推進(jìn)。