第一、管理目標不明確
部分醫(yī)院的運營管理目標不明確、手段落后，僅僅停留在簡單的獎金核算方面，對于成本控制、成本考核、財務預算及其它運營管理了解甚少。
第二、缺少先進的管理方法與工具
雖然目前醫(yī)院的基礎信息系統(tǒng)已經(jīng)建設完善如HIS等，但針于先進的管理方法與工具目前應用的并不是很多，許多的醫(yī)院也僅僅是目前嘗試階段。
由于現(xiàn)有的信息系統(tǒng)很難夠滿足管理的需要，受管理體制、醫(yī)院管理體制、信息系統(tǒng)開發(fā)人員能力等多方面原因制約，目前，成熟且完善、明確梳理清楚醫(yī)院業(yè)務流程的信息系統(tǒng)并不是很多，這嚴重影響了醫(yī)院運營管理措施、管理手段的實施。
面對醫(yī)院運營管理所面臨的問題，ERP使得醫(yī)院提升運營管理變成了現(xiàn)實。醫(yī)院運營管理需要借助一套先進的管理思想以及具備醫(yī)院業(yè)務屬性的ERP來提升醫(yī)院的運營管理。
提到ERP，過去更多應用于制造業(yè)屬于流程或者離散型方面，但今天的ERP的范圍不再僅僅局限于業(yè)務流程，更多是一種先進的管理思想，經(jīng)過多年的應用積累，現(xiàn)在的ERP已經(jīng)集成了最先進的管理精髓，對于起步較晚的醫(yī)院運營管理來講，醫(yī)院ERP的建設已經(jīng)破在眉睫，雖然目前ERP在醫(yī)院的運營管理方面還處于初級應用階段，但我們看到未來提升醫(yī)院運營管理，醫(yī)院ERP的建設必不可缺少。
對于醫(yī)院ERP的建設，我們也看到國外許多的醫(yī)院機構已經(jīng)開始建設ERP來提升醫(yī)院的運營管理水平，國外醫(yī)院成功建設ERP實踐也證明了ERP的成功實施確實能夠給醫(yī)院帶來管理上的提升：
第一、實現(xiàn)各個業(yè)務系統(tǒng)共享
目前來看，國內(nèi)醫(yī)院信息系統(tǒng)比較單一，很難實現(xiàn)信息統(tǒng)一比如物資管理系統(tǒng)、人力資源系統(tǒng)，通常這些信息系統(tǒng)不能實現(xiàn)信息溝通共享從而無法為管理提供綜合中的價值信息，而ERP系統(tǒng)幫助醫(yī)院理順和優(yōu)化采購以業(yè)務流程，并用科學的方法，進行預算和庫存管理。
第二、實現(xiàn)管理流程優(yōu)化提升運營管理
由于其業(yè)務的特殊性，使得醫(yī)院的業(yè)務流程很是復雜，通過ERP系統(tǒng)能夠使得業(yè)務流程更加透明化、醫(yī)院的管理更加規(guī)范化，提升醫(yī)院的運營水平。 ..
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